5 510₽
Секвенирование 16S рРНК дает возможность оценить весь бактериальный состав нашего микробиома, включая бактерии и археи, которые невозможно выявить стандартными методами. Это позволяет врачу быстрее выбрать оптимальную тактику диагностики и лечения.
В ходе исследования анализируется ген 16S рРНК, который встречается у всех бактерий и архей, по которому принято идентифицировать эти микроорганизмы. Метод NGS (секвенирование нового поколения) позволяет “прочитать” множество фрагментов и определить, какие виды бактерий присутствуют в образце, и какова их относительная доля.
Благодаря современному протоколу и настройкам анализа тест подходит для клинических материалов, где бактерии могут присутствовать в небольшом количестве или не расти на стандартных питательных средах.
Достоинства метода: Секвенирование 16S рРНК позволяет выявлять некультивируемые, труднокультивируемые, редкие и новые бактерии.
Важно: результат зависит от правильности подготовки, сбора и качества биоматериала. Поэтому следуйте инструкции по подготовке и доставке образца, чтобы получить наиболее достоверные данные.
Исследование назначают:
Для оценки инфекционной нагрузки в ситуациях, когда возбудителя инфекции не удается точно определить обычными методами. Например, если посев «ничего не показывает» или результат ПЦР-анализа получается неинформативным. В этих случаях 16S рРНК севенирование помогает уточнить бактериальный состав и улучшить диагностические возможности.
Для диагностики нарушений баланса микробиоты. Оценка видового состава микробиома и патогенной нагрузки после курсов антибиотиков, химиотерапии, диетических ограничений, после перенесенных инфекций и воздействия других факторов. Анализ также помогает оценить динамику изменений на фоне лечения и/или коррекции (изменение диеты, прием лекарственных препаратов, пре-, про- и постбиотиков по назначению врача).На исследование микробиома методом секвенирования 16SрРНК лаборатория принимает биологический материал:
для оценки кишечной микрофлоры:
- кал
для оценки микрофлоры репродуктивных органов у женщин:
- мазок из влагалища;
- мазок из цервикального канала.
Если для одного пациента требуется оценить состав микрофлоры нескольких локусов, то для каждого вида биоматериала нужно заказать и оплатить отдельное исследование.
Для получения правильного результата материал для исследования собирают до начала антибактериальной терапии или через 7 дней после ее окончания. Пробиотики не следует принимать в течение 1-2 недель перед исследованием. На состав микробиома могут влиять ингибиторы протонного насоса, антидепрессанты, нейролептики, сахароснижающие препараты, препараты для химиотерапии и другие. Продолжение приема или отмену лекарственных препаратов перед исследованием следует согласовывать с лечащим врачом.
Набор для взятия и хранения биоматериала необходимо получить в медицинском офисе Хромолаб накануне исследования.
Правила сбора кала:
Кал необходимо собрать в 2 пробирки типа эппендорф с транспортной средой.
Варианты сбора:
• С туалетной бумаги: зачерпните остатки кала стерильной палочкой-тампоном.
• Из емкости (горшок, судно): перед дефекацией емкость тщательно вымыть с мылом, ополоснуть водой, обдать кипятком и высушить.
• Из памперса (для младенцев): собрать свежий кал.
Перед отбором тщательно вымойте руки.
1. Откройте пробирку с транспортной средой, не задевая внутреннюю часть крышки и пробирки руками.
2. Положите крышку внутренней стороной вверх.
3. Аккуратно достаньте палочку-тампон из индивидуальной упаковки, не касаясь конца ватного намота.
4. Кончиком палочки-тампон соберите каловые массы, объем которых приблизительно равен объему одного-двух гречневых ядер.
5. Опустите палочку-тампон в пробирку с транспортной средой и тщательно перемешайте в течение одной минуты.
6. Извлеките палочку-тампон из пробирки и выбросьте её.
7. Закройте пробирку крышкой, не задевая внутренние части пробирки и крышки.
После сбора пробирки с материалом следует хранить при температуре +2+8С (на дверце холодильника). Передать в лабораторию в день сбора образцов.
Правила сбора мазков из цервикального канала и влагалища:
Внимание! Сбор мазков осуществляет врач при гинекологическом осмотре. Взятие материала не следует проводить во время менструации. Должно пройти не менее 48 часов после полового акта, УЗИ с использованием вагинального датчика, кольпоскопии.
Проверьте целостность упаковки стерильного зонда. При вскрытии и использовании зонда не следует прикасаться стерильным краем зонда к посторонним предметам, рукам специалиста, коже пациента.
Мазок из влагалища: вращательным движением провести по поверхности боковых стенок влагалища, максимально полно собирая отделяемое. Поместить кончик зонда, содержащий взятый клинический материал, в пробирку с транспортной средой. Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
Мазок из цервикального канала: перед взятием мазка следует удалить слизь и отделяемое влагалища с поверхности шейки матки стерильным марлевым или ватным тампоном. Ввести рабочую часть стерильного зонда в цервикальный канал и совершить 3-5 полных оборотов по часовой стрелке. Извлечь зонд и поместить его кончик, содержащий материал, в пробирку с транспортной средой.
Длинную пластиковую часть зонда аккуратно отломить на 1-1,5 см выше рабочей части таким образом, чтобы в пробирке остался только кончик, содержащий материал. Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
! Недопустимо касаться руками или посторонними предметами внутренней части пробирки при ее открывании и закрывании. Недопустимо использование многоразовых ножниц для обрезания зонда - это может привести к перекрестной контаминации и получению ложных результатов.
Плотно закрутить пробирку крышкой, не допуская зазора и замятия внутренней части.
NGS-секвенирование ампликонов 16S рРНК - идентификация бактерий/архей по составу.
Ампликонное секвенирование 16S рРНК — метод молекулярной идентификации бактерий и архей по последовательности участков 16S рРНК с последующим определением таксономического состава микробиоты в клиническом образце.
Ген 16S рРНК содержит консервативные участки, общие для большинства бактерий и архей, и вариабельные регионы, по которым выполняют таксономическую классификацию. При ампликонном NGS проводится выделение ДНК из клинического материала, амплификация выбранных участков 16S рРНК и высокопроизводительное секвенирование. По результатам биоаналитического пайплайна формируется профиль выявленных таксонов (до рода и иногда до вида) с относительной представленностью.
Клиническая интерпретация: результаты применяются как молекулярная характеристика микробиологического состава образца и могут дополнять (а иногда и замещать) результаты культуральных исследований (посевов) при наличии труднокультивируемых микроорганизмов, низкой бактериальной нагрузки или при предшествующей антибактериальной терапии.
Преимущества метода
• Расширенная выявляемость: обнаружение бактерий, которые трудно культивируются или присутствуют в низкой концентрации.
• Параллельный охват: одновременный скрининг большого спектра бактерий/архей без выбора конкретного возбудителя.
• Устойчивость к неидеальным условиям: молекулярный подход может быть информативен при ограничениях культуры (например, низкая жизнеспособность микроорганизмов).
Ограничения метода:
• Данный метод не определяет: грибы, простейшие и вирусы.
• Данная метод позволяет идентифицировать бактерии точно до рода. Определение до уровня вида не всегда возможно.
• Данный метод не определяет восприимчивость к антибиотикам.
• Данный метод не определяет жизнеспособность бактерий
• Данный метод имеет ограничение в идентификации близкородственных групп таких как Escherichia coli и Shigella. Необходимо дополнительная диагностика при наличии клинический картины.
• Данный метод не всегда позволяют отличить активную инфекцию от колонизации/контаминации; клиническая значимость оценивается в контексте локализации процесса, клинических данных, данных микроскопии/посевов и качества образца.
Показания к назначению исследования:
1. Оценка инфекционной нагрузки и уточнение этиологии. В ряде клинических случаев возбудитель остаётся неустановленным, поскольку стандартные подходы (культуральная диагностика, ПЦР/таргетные тесты) выявляют ограниченный спектр патогенов. 16S rРНК NGS целесообразно применять в ситуациях, требующих расширенного молекулярного поиска, особенно при сложной клинической картине, полимикробности и недостаточном росте микроорганизмов в культуре.
2. Оценка дисбаланса микробиоты и мониторинг ответа на вмешательства. Метод может быть использован для оценки изменений состава микробиоты после факторов, влияющих на микробное сообщество (в т.ч. после курсов антибиотиков, химиотерапии, при ограничительных диетах, после перенесённых инфекций). Также применяется для мониторинга изменений на фоне терапии/коррекции микробиоты (пре-, про- и постбиотики — по показаниям), включая ситуации с хроническими гастроинтестинальными проявлениями и дифференциальной диагностикой состояний, ассоциированных с дисбиозом/изменением микробного профиля.
Основные клинические сценарии
• подозрение на инфекционный процесс при отрицательном/недостоверном посеве или недостаточном росте;
• длительное или рецидивирующее воспаление с необходимостью поиска возможных этиологических факторов;
• полимикробные процессы, когда один возбудитель не объясняет клиническую картину;
• эпизоды после начала антибактериальной терапии, при которых культура может быть ложноотрицательной;
• локализации, где культивирование ограничено.
Метод особенно полезен, когда стандартные посевы дают ограниченный ответ или не отражают полный профиль бактериального сообщества.
Покупайте сегодня, а платите от 2 до 6 месяцев без переплат. Первый платеж сразу, остальные - раз в две недели. Никакие документы не нужны, просто войдите в свой профиль в Яндекс или зарегистрируйтесь. При отмене заказа деньги вернутся на карту, как при обычной оплате.
Сплит доступен на срок от 2-х до 6-ти месяцев
Запись на эту дату уже закрыта, пожалуйста выберите другую.
