Метагеномное секвенирование Low WGS - это современный метод молекулярной диагностики, который позволяет оценить состав микробиоты и выявить нарушения микробного баланса в различных биологических образцах.
При исследовании определяется генетический материал (ДНК) микроорганизмов, содержащихся в биоматериале. Метод помогает подробно оценить состав микробного сообщества, а также соотношение различных представителей микробиома. Исследование может выполняться для различных типов биоматериала.
Low WGS, в отличие от mNGS (глубокого метагеномного секвенирования), выполняется с меньшей глубиной секвенирования и применяется преимущественно для выявления дисбиотических нарушений, анализа микробного разнообразия и
динамического наблюдения за изменением микрофлоры. Метод позволяет получить общую картину микробного сообщества и оценить баланс микроорганизмов.
Исследование может быть полезно в следующих ситуациях:
- при подозрении на кишечный дисбиоз;
- при хронических нарушениях пищеварения (вздутие, диарея, запоры);
- при воспалительных заболеваниях кишечника;
- после завершения антибактериальной терапии;
- при рецидивирующих урогенитальных инфекциях;
- при нарушении микрофлоры урогенитального тракта;
- для контроля изменений микрофлоры на фоне лечения, питания или коррекции образа жизни.
Важно учитывать, что состав микробиоты индивидуален и может меняться под влиянием питания, лекарственных препаратов, образа жизни, возраста и других факторов. Интерпретацию результатов рекомендуется проводить совместно с лечащим врачом с учетом симптомов и данных других обследований.
На исследование “Метагеномное секвенирование Low WGS” лаборатория принимает биологический материал:
для оценки кишечной микрофлоры:
- кал
для оценки микрофлоры урогенитального тракта::
- мазок из влагалища;
- мазок из цервикального канала;
- мазок из уретры;
- эякулят
для определения инфекционных возбудителей в крови:
- кровь с ЭДТА
К заказу целесообразно приобщить выписки от лечащего врача и/или заполнить анкету.
Если для одного пациента требуется оценить состав микрофлоры нескольких локусов, то для каждого вида биоматериала нужно заказать и оплатить отдельное исследование.
Для получения правильного результата материал для исследования собирают до начала антибактериальной терапии или через 7 дней после ее окончания. Пробиотики не следует принимать в течение 1-2 недель перед исследованием. На состав микробиома могут влиять ингибиторы протонного насоса, антидепрессанты, нейролептики, сахароснижающие препараты, препараты для химиотерапии и другие. Продолжение приема или отмену лекарственных препаратов перед исследованием следует согласовывать с лечащим врачом.
Набор для взятия и хранения биоматериала необходимо получить в медицинском офисе Хромолаб накануне исследования.
Правила сбора кала:
Кал необходимо собрать в 2 пробирки типа эппендорф с транспортной средой.
Варианты сбора:
• С туалетной бумаги: зачерпните остатки кала стерильной палочкой-тампоном.
• Из емкости (горшок, судно): перед дефекацией емкость тщательно вымыть с мылом, ополоснуть водой, обдать кипятком и высушить.
• Из памперса (для младенцев): собрать свежий кал.
Перед отбором тщательно вымойте руки.
1. Откройте пробирку с транспортной средой, не задевая внутреннюю часть крышки и пробирки руками.
2. Положите крышку внутренней стороной вверх.
3. Аккуратно достаньте палочку-тампон из индивидуальной упаковки, не касаясь конца ватного намота.
4. Кончиком палочки-тампон соберите каловые массы, объем которых приблизительно равен объему одного-двух гречневых ядер.
5. Опустите палочку-тампон в пробирку с транспортной средой и тщательно перемешайте в течение одной минуты.
6. Извлеките палочку-тампон из пробирки и выбросьте её.
7. Закройте пробирку крышкой, не задевая внутренние части пробирки и крышки.
После сбора пробирки с материалом следует хранить при температуре +2+8С (на дверце холодильника). Передать в лабораторию в день сбора образцов.
Правила сбора мазков из цервикального канала и влагалища:
Внимание! Сбор мазков осуществляет врач при гинекологическом осмотре. Взятие материала не следует проводить во время менструации. Должно пройти не менее 48 часов после полового акта, УЗИ с использованием вагинального датчика, кольпоскопии.
Проверьте целостность упаковки стерильного зонда. При вскрытии и использовании зонда не следует прикасаться стерильным краем зонда к посторонним предметам, рукам специалиста, коже пациента.
Мазок из влагалища: вращательным движением провести по поверхности боковых стенок влагалища, максимально полно собирая отделяемое. Поместить кончик зонда, содержащий взятый клинический материал, в пробирку с транспортной средой. Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
Мазок из цервикального канала: перед взятием мазка следует удалить слизь и отделяемое влагалища с поверхности шейки матки стерильным марлевым или ватным тампоном. Ввести рабочую часть стерильного зонда в цервикальный канал и совершить 3-5 полных оборотов по часовой стрелке. Извлечь зонд и поместить его кончик, содержащий материал, в пробирку с транспортной средой.
Длинную пластиковую часть зонда аккуратно отломить на 1-1,5 см выше рабочей части таким образом, чтобы в пробирке остался только кончик, содержащий материал. Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
! Недопустимо касаться руками или посторонними предметами внутренней части пробирки при ее открывании и закрывании. Недопустимо использование многоразовых ножниц для обрезания зонда - это может привести к перекрестной контаминации и получению ложных результатов.
Плотно закрутить пробирку крышкой, не допуская зазора и замятия внутренней части.
После сбора пробирки с материалом следует хранить при температуре +2+8С (на дверце холодильника). Передать в лабораторию в день сбора образцов или не позднее следующего дня.
Правила сбора мазков из уретры.
Внимание! Сбор мазков осуществляет врач во время осмотра.
Перед взятием мазков должно пройти не менее 48 часов после полового акта.
Необходимо воздержаться от мочеиспускания перед отбором мазка:
женщинам - 2-3 часа
мужчинам - 1,5-2 часа.
Проверьте целостность упаковки стерильного зонда. При вскрытии и использовании зонда не следует прикасаться стерильным краем зонда к посторонним предметам, рукам специалиста, коже пациента.
Взятие мазка у женщин: ввести рабочую часть стерильного зонда в уретру на глубину 1-1,5 см, сделать 3-5 полных оборота по часовой стрелке.
Взятие мазка у мужчин: ввести рабочую часть стерильного зонда в уретру на глубину 2-4 см, сделать 3-5 полных оборота по часовой стрелке.
! Недопустимо касаться руками или посторонними предметами внутренней части пробирки при ее открывании и закрывании.
Извлечь зонд из уретры и поместить его кончик, содержащий собранный материал, в пробирку с транспортной средой. Тщательно перемешать взятый биоматериал с жидкостью в пробирке в течение одной минуты. Извлечь зонд из пробирки и выбросить его. Закрыть пробирку крышкой, не задевая внутренние части пробирки и крышки.Плотно закрутить пробирку крышкой, не допуская зазора и смятия внутренней части. Повторить манипуляцию со второй пробиркой.
Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
После сбора пробирки с материалом следует хранить при температуре +2+8С (на дверце холодильника). Передать в лабораторию в день сбора образцов или не позднее следующего дня.
Правила сбора эякулята:
Для отбора эякулята потребуются стерильный контейнер (баночка), стерильный зонд и пробирки со специальной транспортной средой (в наборе для взятия и хранения проб).
Условия подготовки: перед сбором эякулята должно пройти не менее 48 часов после полового акта. Следует воздерживаться от мочеиспускания в течение 1,5-2 часов перед сбором.
Проверьте целостность упаковки стерильного зонда.
Вымойте руки с мылом.
Проведите гигиеническую обработку половых органов.
Получите эякулят путем мастурбации, соберите весь объем в стерильный контейнер.
Вскройте упаковку стерильного зонда, перенесите с помощью зонда биоматериал из контейнера в пробирку с транспортной средой в объеме не более ⅓ от объема самой транспортной среды. Перемешайте в течение 1 минуты.
!Недопустимо касаться руками или посторонними предметами внутренней части пробирки при ее открывании и закрывании.
Извлеките зонд из пробирки и выбросьте его. Закройте пробирку крышкой, не задевая внутренние части пробирки и крышки. Плотно закрутите пробирку крышкой, не допуская зазора и замятия внутренней части крышки.
Повторите манипуляцию со второй пробиркой с транспортной средой.
Цвет транспортной среды с муколитиком может измениться после помещения в нее клинического материала.
После сбора пробирки с материалом следует хранить при температуре +2+8С (на дверце холодильника). Передать в лабораторию в день сбора образцов.
Правила сбора крови:
Подготовка пациента: без особенностей.
Взятие крови из вены производится в пробирку с ЭДТА.
Материал предназначен для врачей.
Информация, размещенная в этом разделе, не может быть использована пациентом для самостоятельной диагностики и лечения.
Метагеномное секвенирование Low WGS (low-depth whole genome sequencing) — молекулярно-генетический метод оценки микробиоты, основанный на низко глубинном секвенировании суммарного генетического материала микроорганизмов, присутствующих в клиническом образце.
Метод позволяет охарактеризовать состав микробного сообщества, определить относительное содержание основных таксонов и выявить признаки нарушения микробного баланса (дисбиотических изменений). Исследование может выполняться для различных типов биоматериала.
После секвенирования проводится биоинформатическая обработка данных с последующей таксономической классификацией выявленных микроорганизмов. В отчете представляются основные обнаруженные группы микроорганизмов и их относительное соотношение.
В отличие от mNGS, исследование Low WGS выполняется с меньшей глубиной секвенирования и ориентировано преимущественно на оценку структуры микробиоты,
анализ микробного разнообразия, выявление дисбиотических нарушений, мониторинг изменений микробного сообщества в динамике. Метод подходит для оценки преобладающих микроорганизмов и общей архитектуры микробиоты, однако имеет ограниченную чувствительность в отношении низкопредставленных патогенов.
Преимущества метода Low WGS
- одновременная оценка большого числа микроорганизмов без обязательного культивирования;
- возможность исследования различных типов биоматериала;
- оценка микробного разнообразия и структуры микробного сообщества;
- выявление признаков нарушения микробного баланса;
- возможность динамического наблюдения для оценки эффективности терапии, изменения питания или образа жизни.
Внимание! Обнаружение ДНК микроорганизма не всегда подтверждает его клиническую значимость. Интерпретация результатов требует сопоставления с клинической картиной и данными других исследований.
Исследование может быть полезным для комплексной оценки микробного баланса при:
- функциональных нарушениях желудочно-кишечного тракта;
- воспалительных заболеваниях кишечника;
- хронической диарее или запорах;
- синдроме избыточного бактериального роста;
- рецидивирующих урогенитальных воспалительных процессах;
- нарушении микробиоты влагалища;
- мониторинге состояния микробиоты после антибактериальной терапии.
Покупайте сегодня, а платите от 2 до 6 месяцев без переплат. Первый платеж сразу, остальные - раз в две недели. Никакие документы не нужны, просто войдите в свой профиль в Яндекс или зарегистрируйтесь. При отмене заказа деньги вернутся на карту, как при обычной оплате.
Сплит доступен на срок от 2-х до 6-ти месяцев
Запись на эту дату уже закрыта, пожалуйста выберите другую.